生態環境部近岸海域生態環境重點實驗室是經生態環境部批準，由“國家海洋局近岸海域生態環境重點實驗室”（成立于1998年）更名而來，依托單位為國家海洋環境監測中心。
實驗室側重于我國近岸海域生態環境保護與監測評價技術的學科聯合與交叉研究。在學術和管理上相對獨立，本著開放、流動、聯合的運行機制，面向國內外從事海洋生態環境監測與保護研究的同行開放，鼓勵相關學科有突出學術成就的國內外科研人員來我實驗室進行短期訪問與合作研究，或聯合培養研究生。
實驗室將為相關研究的科技人員提供必要條件，并設立開放基金，資助有關人員從事近岸海域生態環境領域的應用基礎和應用技術研究，努力把本實驗室建設成為我國海洋生態環境監測與保護領域的國家級科研基地和人才培養基地。
