生態環境部海洋生態環境整治修復重點實驗室面向國家海洋生態文明建設，緊密圍繞海洋生態環境整治修復技術和管理支撐的需求，開展人類活動與海洋生態環境響應機制、海洋生態環境整治修復技術與應用、海洋生態環境綜合治理政策等方面研究，為提高海洋生態環境治理水平，構建現代化海洋生態環境治理體系提供科技支撐。實驗室主要研究方向如下：
（一）人為活動的海洋生態環境響應與受損機理研究
研究沿海地區主要入海污染物排放、入海河流水系通量及圍填海海洋開發利用等變化趨勢，評估沿海人類活動引起的海洋生態系統響應特征，識別區域海洋資源、生態環境受損問題，揭示其驅動機制與受損機理。
1.人為活動的海岸帶基礎環境影響研究。研究圍填海、養殖用海、典型海洋與海岸工程等沿海地區開發利用活動，對海岸帶生態景觀格局、河海連通性變化以及海灣水動力、海岸侵蝕、海底沖淤等影響，識別海岸帶基礎環境的重大變化和風險等。
2.陸源排污的海洋環境污染負荷研究。研究沿海社會經濟和產業發展的產排污特征，構建“沿岸匯水區-陸源排口-近岸海域”的源匯響應關系，分析評估陸源排污對近岸海域環境質量改善的污染負荷及其變化趨勢，識別陸海統籌的海洋環境污染防治重點區域和對象等。
3.海洋生態退化的人為活動成因診斷分析。研究人為活動導致的河口、海灣、濱海濕地等海洋生態系統響應特征、演變過程、影響機制等，評估區域海洋生態退化存在的主要風險和突出問題，識別需要重點加強監管調控的主要人為活動，以及需要開展生態恢復修復的重點區域和對象等。
（二）海洋生態環境整治修復技術與應用
研究河口污染物減排、海灣環境容量提升等海洋環境整治措施和海洋生態系統修復技術，基于“3S”技術、模型模擬和信息數據技術，研究陸海多源環境信息集成、綜合治理技術方法及效果評估的可視化應用平臺，提供海洋生態環境整治修復及監管技術支撐。
1.河口海灣環境治理技術。研究流域-河口-海灣污染物削減、河口濕地污染物凈化、海灣水環境容量提升等環境治理技術方法。
2.受損海洋生態系統修復恢復與監測評估技術。研究砂灘養護、侵蝕海岸防護、生態海堤和岸灘生境恢復等海洋生態功能修復技術，海洋整治修復工程實驗模擬和海洋生態修復監測評估方法等。
3.流域-海洋水環境綜合模擬模型構建。研究構建流域-海洋水環境綜合模擬模型，為生態環境變化評估、整治修復工程方案優化等提供科學依據和方法技術。
4.海洋生態環境治理工程信息集成與可視化。基于“3S”技術、模型模擬和信息數據技術，研究陸海多源環境信息集成、整治修復技術方法及效果評估的可視化應用平臺。
（三）海洋生態環境整治修復監管與綜合治理政策
開展海洋生態環境整治修復標準規范研究，探索監測-考核-監管全鏈條的海洋生態環境保護修復監管對策，研究海洋生態環境損害賠償、生態補償制度及區域海洋生態環境綜合治理體系與管理政策。
1.海洋生態環境整治修復標準規范。研究海洋環境治理、生態修復的定量化目標指標，研究構建海洋生態環境整治修復技術標準規范。
2.海洋生態環境修復監管對策研究。研究海洋生態環境保護修復的陸海統籌區域聯動機制，探索監測-考核-監管全鏈條的海洋生態環境整治修復監管對策。
3.海洋生態環境損害與生態補償。研究重要海洋生態系統保護補償標準與模式，開展海洋開發利用的生態環境效益與損失評估，研究海洋生態環境損害鑒定評估技術。
4.陸海統籌的海洋生態環境綜合治理政策。基于區域海洋環境容量、生態功能及海洋開發保護存在的主要問題，評估海洋生態保護修復效益及治理成本，提出區域海洋生態環境綜合治理方案、機制及政策。
